EST（Expressed Sequence Tag）表达序列标签是指随机从构建的cDNA文库中挑选克隆，并进行5'端和3'端一次性测序所获得的短cDNA部分序列，一般长度为150～500bp。虽然EST只是完整基因的一部分，但是其序列长度已足以代表该基因，因此可以采用EST特异性地标记基因。目前，EST的数目GenBank中其他核苷酸序列多，所以在EST 库中更容易搜寻到新的基因，它已被广泛地应用于基因的识别。另外，由于EST 来源于特定组织在特定环境下总mRNA所构建的cDNA文库，因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。

EST测序的应用
基因表达谱分析
SSR标记的发掘
作为构建分子标记连锁图谱的探针
生物信息分析
1. 基本信息分析
a.从峰图到序列的转化，去除低质量的序列和载体序列
b.序列拼接
c. EST注释
d. ORF预测及分析
e. 基因注释（NR、NT数据库）
2. 高级信息分析
a.功能蛋白分析
b.Interpro功能域分析
c.序列属性及其对应Unigene的分析
d. COG分析
e. Pathway分析
提供结果
 1. 测序峰图及序列文件
 2. 生物信息分析报告