small RNA是一类长度在18-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA等。它的主要功能是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化及个体发育生殖等重要生物学过程。
small RNA测序是通过高通量测序,研究某一物种特定组织在特定状态下的所有已知小RNA,并发现新的、该物种特有的小RNA及其靶标,为小RNA功能研究及该物种的基因调控机制研究提供有力工具。
应用领域:
疾病检测与监控
样本全转录本信息获取
基因注释及筛选
基因结构分析
产品优势:
技术稳定性好:技术稳定,建库稳定性好
检测精度高:几百万级深度检测,可以检测出低丰度small RNA
分析内容全面:不仅可以分析microRNA,还可以分析siRNA
分析内容
测序数据及其质量控制 | 测序碱基质量值 测序数据产出统计 |
sRNA分类注释 | ncRNA及重复序列注释 与参考基因组比对 公共及特有序列分析
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miRNA分析 | miRNA鉴定、 miRNA碱基偏好性分析 miRNA碱基编辑分析 miRNA家族分析 |
miRNA表达量分析 | miRNA定量、 miRNA表达量总体分布
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miRNA差异表达分析 | 差异表达miRNA筛选、 差异表达miRNA聚类分析 |
miRNA靶基因预测 | |
差异表达miRNA靶基因注释 |