illumina HumanHT-12 v4 Beadchip
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illumina HumanHT-12 v4 Beadchip

产品属性

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  • 型号illumina HumanHT-12 v4 Beadchip
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产品描述

芯片超过47,000个探针,覆盖31,000多个注释基因,可同时检测12个样本,这样直接减少了样本之间的不可控因素,使得样本之间条件更加一致,数据的可比性更高。使用专门为illumina全基因组表达解决方案而优化的Total-Prep RNA Labeling Kit ,可以从50 ng总RNA起始通过单轮体外转录完成样本标记,检出率高达99.99%。基因信息来源RefSeq 数据库 ( Release38,2009117),UniGene 数据库 (Build 199)。
    此芯片应用范围包括:基因的功能研究;寻找新基因,解读己知基因未知功能;疾病与正常的基因表达差异研究,建立疾病表达谱;肿瘤机制研究,寻找抗癌药物作用靶点,肿瘤早期诊断,预防;研究细胞的发育,分化,凋亡,信号调控网络;药物筛选,寻找药物靶点,作用机制,毒理研究。

适用物种
 人类
产品规格
 每张芯片可平行处理12个样本,一套试剂包括2-6张芯片
转录本数/芯片
  >47,000
位点信息
 NCBI RefSeq (RefSeq Release 38 (November 7, 2009) 及UniGene (Build 199)
芯片优点
 1.性价比高,HumanHT-12与houman WG-6 BeadChip 的探针数相同但通量更大,每张芯片可同时做12个样本,专为高效率的全基因组关联及基于表达的数量性状遗传(eQTL)研究而设计。
2.位点信息更新快,候选基因挑选自NCBI RefSeq (Build 36.2, Rel 22) 及UniGene (Build 199) 数据库。
3.可以使实验组和对照组的样本实验在一张芯片上同时进行,尽可能的增加两组样本间的一致性,使得后期数据更具说服力

技术原理:直接杂交(Direct Hybridezation
Illumina的基因表达研究芯片采用Direct Hybridization“直接杂交”技术原理,示意如下:

上图:技术原理:一段约50bp基因特异探针与一段短的地址序列相联,探针会与生物素标记的目标RNA杂交。
右图:简单的操作流程,3天7步操作,手工操作的时候不超过3个半小时。
 
Illumina基因表达研究芯片的突出特点表现为:
a. 低上样量
每个芯片在一轮反转录(IVT)的情况下仅需50-200ngRNA。
b. 高重复性
微珠芯片设计中的“无序自组装”方式,每种类型的30倍重复,“片中片“的设计等特点保证微珠芯片的高重复性。重复性实验表明芯片的批间重复性平均为99.6%。重复样本在log1.3范围内相关性达到 99.8% 。
c.高特异性-专利动力学扫描选取的探针
Illumina通过生物信息学分析,针对每个基因设计2-3个候选探针,这些候选探针被用来和26种人不同组织样本进行杂交实验,所得数据通过专利算法分析后选择特异性和反应性能zei好的唯一探针制成芯片。一个基因只需要一个探针,长度约为50bp。探针的设计充分保证了其特异性及高灵敏度。
d. 高数据准确性-qPCR验证
定量PCR(qPCR)是检验芯片数据的黄金标准,实验表明全基因组表达芯片(Human-6,Ref-8)和qPCR相关系数R2=0.93,特定基因组研究芯片和qPCR相关系数R2=0.97
e. 高性价比-有效降低芯片成本
Illumina基因组表达芯片价格是传统商品化芯片的1/2-1/3。

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北京康普森生物技术有限公司

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