SMALL RNA测序产品概述

Small RNA是一类大小约17~40个碱基的单链小分子RNA。小RNA在细胞内有重要的调控功能，具有作为疾病诊断标记物或药物靶标的潜力，正被广泛研究。新一代高通量测序可以在一次测序中获得样本细胞中小RNA的序列信息，能够快速鉴定出不同组织、不同发育阶段、不同疾病状态下已知和未知的小RNA表达水平及其表达差异，为研究小RNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力工具，尤其能通过测序鉴别新的小RNA。Small RNA主要包括 microRNA、siRNA(small interfering RNA)、piRNA(piwi-interacting RNA)三类。

应用领域

1、直接参与转录后水平对生物学功能的调控

2、作为生物标志物进行疾病检测和***

3、作为竞争性内源RNA参与生命活动的调节

测序策略

样本要求

样本类型：完整且无污染的Total RNA;

Total RNA需求量（单次）≥ 5.0 μg

RNA浓度： ≥200 ng/μL

RNA纯度：OD260/280=1.8-2.2，OD260/230 ≥2.0；RIN ≥8.0，18S ≥1.5;

样本寄送

Total RNA或者组织样本必须采用干冰进行运输，确保样本到达实验室时仍有干冰剩余，否则严重影响RNA质量。

技术流程

 

 

常见问题

Q： 研究small RNA需要提供什么样品？

客户只需提供样品总RNA，无需将small RNA进行分离。提取方法不能按照做转录组的标准提取的，提取过程中不能过柱，不能用LiCl沉淀，否则small RNA会丢失，不能用于small RNA建库。

Q：small RNA测序原理是怎样的？

Small RNA（micro RNAs、siRNAs和 pi RNAs等）是生命活动重要的调控因子，在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。Illumina能够对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析等研究。实验时首先将18-30 nt范围的Small RNA从总RNA中分离出来，两端分别加上特定接头后体外反转录做成cDNA再做进一步处理后，利用测序仪对DNA片段进行单向末端直接测序。通过Illumina对Small RNA大规模测序分析，可以从中获得物种全基因组水平的miRNA图谱，实现包括新miRNA分子的挖掘，其作用靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析等科学应用。