染色质免疫共沉淀技术（ Chromatin Immunoprecipitation , ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质和DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的 ChIP-Seq（ChIP-sequencing，简称为ChIP-Seq）技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的 DNA 区段。
ChIP-Seq 的原理是：首先通过染色质免疫共沉淀技术（ ChIP ）特异性地富集目的蛋白结合的 DNA 片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的 DNA 片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因