基于LC-MS的靶向方法被越来越多地应用于发现后蛋白质组学研究，其中，作 为转化研究的第一个阶段，验证研究尤其受重视1 。此类实验必须以高通量、高 灵敏度、宽泛的线性动态范围和优异的选择性分析大规模的组学样品，因此技 术挑战性极高。基于多反应监测(MRM)的方法具有证明生物标志物可接受性所 需分析性能的潜力。 本应用纪要将串联四极杆质谱仪和飞行时间质谱仪与纳升级和微流(ionKey)液 相色谱平台相结合，对经胰蛋白酶酶解的未分馏、未除高丰度的人血清样品中 的肽进行MRM的定量分析，并全面比较了不同的LC-MS配置。不同的LC和MS 平台相结合组成了八套不同的LC-MS配置。此外，我们还比较了这些平台的通 量、灵敏度、线性和重现性，以证明它们在转化研究中用于分析大规模样品组 的适用性。