应用Xevo TQ-S、MassLynx和 Skyline开发高灵敏度的 自动化SRM/MRM肽段 检测方法

应用领域:蛋白/抗体/蛋白质组

检测样品:蛋白质组学

检测项目:定量验证

方案摘要

靶向LC-MS/MS SRM/MRM验证是连接蛋白质生 物标志物发现和验证分析的关键技术。潜 在生物标志物通常是在较小规模的相对定 量发现研究中被发现。此类研究的典型瓶 颈是如何选择合适的特征性肽段用于SRM/ MRM定量,以及如何开发与三重四极杆质 谱仪联用的LC/MS方法进行验证。在实验 很复杂的情况下,软件在正确选择目标 蛋白质的特征肽段上十分重要。 利用分析得到的母子离子的通道检测目 标肽段,通常会针对每种肽段进行优化。 本技术简报将介绍使用Skyline为Waters® Xevo TQ-S质谱仪选择肽段和通道并进行方 法开发的过程,同时包括分析复杂合成 基质中的致敏肽段标准品的结果。Skyline 是一款开源文档编辑器,可用于创建和 分析靶向蛋白质组学实验 。

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