DNA核酸浓度的测定实验应用方案(超微量紫外分光法)

应用领域:基因/基因组/测序

检测样品:DNA

检测项目:DNA核酸浓度的测定

方案摘要

DNA核酸浓度的测定实验应用方案(超微量紫外分光法)

引言

寡核苷酸,单链、双链DNA,以及RNA可以定量溶于缓冲液,构成核酸的嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键,使核苷核和核酸在紫外线光具有特征性的吸收光谱,最大吸收峰为260nm。窄光带紫外分光光度计,长260nm.,比色杯光径1cm,1个吸光度值(1A)相当于50ug/ml双螺DNA,40ug/ml单螺旋DNA或RNA),20 ug/ml寡核苷酸。

测试前,选择正确的程序,输入原液和稀释液的体积,尔后测试空白液和样品液。然而,实验并非一帆风顺。读数不稳定可能是实验者最头痛的问题。灵敏度越高的仪器,表现出的吸光值漂移越大。

原理

紫外分光光度法基于DNA链上碱基的苯环结构在紫光区具有较强吸收,DNA/RNA在260nm处有最大的吸收峰,蛋白质在28Onm处有最大的吸收峰,盐和小分子则集中在230nm处。因此,可以用260nm波长进行分光测定核酸浓度,OD值为1相当于大约50ug/ml双链 DNA,单链DNA浓度约为33ug l ml,RNA约为40ug/ml,寡核苷酸约为35ug/ml。如用1cm光径,用 H,O稀释DNA/RNA样品n倍并以H,O为空白对照,根据此时读出的OD260值即可计算出样品稀释前的浓度:

DNA (mg/ml ) =50×OD260 读数×稀释倍数/1000RNA (mg/ml) =40×OD260读数×稀释倍数/1000。

A280nm是蛋白和酚类物质最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA的A260/A280比值为1.8,纯RNA为2.0。假如比值低,表示受到蛋白(芳香族)或分类物质的污染,需要纯化样品。比值=1.5相当于50%蛋白质/DNA溶液。A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA和RNA的A260/A230比值为2.5。若比值小于2.0标明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样品。

A320nm或A340nm为检测溶液样品的浊度,该值应该接近0.0。假如不足,标明溶液中有悬浮物,需要纯化样品。

仪器及试剂

UL-1000超微量紫外可见分光光度计

比色杯

样本DNA

双蒸水

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