用DS3000 Compact CE Sequencer 检查下一代测序分析数据

应用领域:分子生物学,基因/基因组/测序

检测样品:HCT116的NGS变体

检测项目:用DS3000 Compact CE Sequencer 检查下一代测序分析数据

方案摘要

在下一代测序分析中检测出的基因组上的突变(以下简称NGS),由于分析的简便性,通过Sanger测序可以检测出来(参考文献(1)。在此,介绍用 DS3000 Compact CE Sequencer以下简称DS3000)、进行NGS变体分析的实例。最初,通过从人类结肠癌细胞株(HCT116)中提取的基因组DNA,对12个单碱基替换进行了分析。DS3000的碱基识别程序可以检测出所有单碱基替换。此外,通过用Mutation Surveyor ver. 5.1.2, SoftGenetics公司)分析在DS3000中获取的波形数据,可以检测出突变率的定量、碱基的插入或缺失。本仪器是研究专用仪器,并未获得基于药事法的医疗仪器的认证。因此,此仪器不可用于诊断。

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