Real-Time Search实时检索助力Orbitrap Eclipse实现TMT 高通量精准定量

应用领域:多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组

检测样品:TMT标记定量

检测项目:DIA定量分析

方案摘要

TMT标记定量是蛋白质组学多重定量分析研究中使用最广泛、也是

功能最强大的研究策略,有实验周期短、检测通量高、缺失值少等

优点,目前TMT标记已经可以同时完成最多18个样品的定性定量。

这项技术面临的主要挑战为,共隔离肽段的干扰和MS2谱图中共碎

裂导致定量精度的折损。为了解决这一挑战,在Orbitrap Fusion和

Orbitrap Fusion Lumos “三合一”系列质谱SPS-MS3方法的基础

上,赛默飞基于2019年新推出的Orbitrap Eclipse质谱,开发了一种

称为RTS-SPS-MS3(RTS,Real Time Search,实时检索)[1]的新

技术。

本文中,我们借助Thermo Scientific™ Pierce™ TMT11plex yeast酶

解肽段标准品、掺入6种蛋白质消化物的TMT10plex标记的细胞或

血浆样品、酵母和去高丰度血浆混合样品,评估了Orbitrap Eclipse

质谱仪特有的RTS-SPS-MS3 TMT定量方法的通量和定量准确度。

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