【应用文档】实验室数据的自动化方案(系列四)

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检测项目:【应用文档】实验室数据的自动化方案(系列四)

方案摘要

自动化不是一座孤岛—将Mgears集成到您的IT基础架构中 

在最近的推文中,我们讨论了自动化的必要性,以及Mestrelab针对于这个问题的解决方案,并提供了几个案例。但自动化不会独立存在。过程的输入和输出(或者更确切地说,实现这些连接的容易程度)可以决定整体自动化的成败。如果所有结果都需要手动转移到公司数据库中,那么拥有出色的自动化处理10000个样本是没有意义的!

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那么,Mgears如何进行这些集成,将宝贵的时间节约下来转化为成熟的企业解决方案呢?

Mnova已经有一些创建好的解决方案,例如,Mgears内置了与某些ELN或Mnova数据库的连接,您只需选择几个选项即可启用该连接。也许没有那么高科技,但仍然是一个可行的选择,它可以轻松将数据导入到另一个系统中,从而允许批量更新。

也许您的工作环境有某种样本管理器,并且您希望Mgears处理样本,可能用于不同的工作流,并将结果返回到该系统?这可以很容易地实现。内置的“订单”功能允许Mgears记录包含处理过程和使用哪个工作流的文件。像一个优秀的快餐厨师一样,Mgears会挑选订单,进行分析,然后写出报告和机器可读的结果文件,主系统可以对其进行扫描。

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但是,如果现在还没有满足您需求的解决方案,该怎么办?您能做些什么?

编写定制化脚本

Mgears在引擎中有几个脚本端口,因此可以创建一个小脚本来完成流程中的特定任务。Mnova脚本工具包具有实用程序对象,可以轻松连接到关系数据库或web服务;这些脚本将自动运行每个样本数据,从而实现无缝集成。

其中一个例子是检索结构。在以前的推文中我们介绍到Mgears可以根据结构来验证NMR数据,并通过文件名将结构与NMR数据匹配,整个过程是智能且自动化的,但如果您没有结构文件,更没有正确的名称,该怎么办?在许多组织中,通常可以使用公司数据库,能够通过web服务从ID中查找结构。也许您的结构ID存在于NMR文件中?如果是这样的话,如果我们可以直接在Mgears中查找结构,那不是很好吗?

这很容易实现。由于Mnova的内置对象可以与web服务对话、处理结构和查询NMR原始文档,我们可以从谱图参数中检索ID,查询web服务,检索化学结构,并将其插入文档中。这项工作是用一个小脚本完成的,可以由熟练的用户自己写,而不需要专业服务。如果没有“技术熟练”的用户,Mestrelab乐意为您提供专业的服务。

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第二个示例涉及将结果写入关系数据库。想象一下,您正在使用系统适用性测试模块来评估LCMS仪器的性能。Mgears制作了一个很好的结果报告和结果的CSV文件,但在网页上有一个显示这些结果的全局性报告不是很好吗?也许您有Spotfire或Power BI,想制作一些简单的视图供用户从任何地方访问?如果Mgears能够直接将数据以这种方式存入数据库就好了!

小结

过程自动化通常是更大的工作流程的一部分。如果我们能够将过程嵌入到工作流中,使数据无缝地流入和流出,我们将获得最大的价值。我们希望本文能展示Mestrelab的Mgears自动化如何为您实现这一点。

本文是我们关于数据工作流自动化和集成的系列文章的第四部分。如果您对这个话题感兴趣,请继续关注未来几个月的更多内容!

查看本系列的第一篇文章:未来实验室的发展之路…是时候开始行动了 

查看本系列的第二篇文章:人人享有自动化

查看本系列的第三篇文章:利用自动化分析的力量:让你的想法流动起来 

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