针对3D MSI的技术瓶颈，德国吉森大学的Bernhard Spengler教授团队开发了最新的自动聚焦三维质谱成像技术，成果发表在国际顶尖杂志Nature Methods——Autofocusing MALDI mass spectrometry imaging of tissue sections and 3D chemical topography of nonflat surfaces（Nature Methods, 2017, 14(12): 1156）。这是继“1.4μm超高分辨率质谱成像技术”之后，Spengler教授团队的又一次突破。该技术通过把激光三角测量系统整合到AP-SMALDI10 MSI系统中，实现了小于10μm的侧向分辨率。如下图所示，自动聚焦MALDI质谱成像系统能够清晰的可视化苜蓿叶片中糖苷类和脂类物质的三维空间分布（Fig.c），曼氏裂体吸虫中磷脂类物质空间特异性分布（Fig.e, f），以及小鼠脑部磷脂类物质的组织空间特异性分布（Fig.g, h）。该技术的出现可直接对三维生物样品进行质谱检测，其自动聚焦技术能够大大提升检测效率和检测通量，并有效避免样品中检测信号的缺失。