无需手动纯化直接分析合成的寡核苷酸

应用领域:分子生物学,生物制药/仿制药,分子生物学,生物制药/仿制药

检测样品:高盐浓度溶液

检测项目:寡核苷酸

参考标准:Journal of Chromatography A, 1999, 848, 435–442

方案摘要

无需手动纯化直接分析合成的寡核苷酸

高盐浓度溶液中寡核苷酸的直接二维液相色谱分析,在第一维中进行在线脱盐,随后在第二维中进行 IP-RPLC 分析。

摘要 

由亚磷酰胺化学法合成的寡核苷酸通常使用离子对反相液相色谱 (IP-RPLC) 和阴离 子交换色谱进行分析和纯化。在 IP-RPLC 分析中,阴离子交换纯化馏分的高含盐量 会削弱寡核苷酸参与离子配对的能力。这就需要在 IP-RPLC 分析之前对样品进行脱 盐,这一步骤通常使用离心过滤器手动完成。 本应用简报展示了高盐浓度溶液中寡核苷酸的直接二维液相色谱分析:在第一维 ( 1 D) 中进行在线脱盐,随后在第二维 (2 D) 中进行 IP-RPLC 分析。在该设置中,二维 液相色谱的使用提高了工作流程速度,同时避免了手动的样品前处理过程。    

结论 

使用配备主动溶剂调制的 1290 Infinity II 二维液相色谱系统的中心切割二维液相色 谱分析可实现高盐浓度溶液(如寡核苷酸 合成后得到的阴离子交换纯化馏分)中寡 核苷酸的直接分析。在第一维中实现有效 的在线脱盐后,在第二维中进行 IP-RPLC 分析。比起经离心过滤器手动脱盐后再进 行一维 IP-RPLC 分析,二维液相色谱法可 使工作流程的速度提高三倍以上。此外, 无需进行样品前处理可节省人力。

参考文献

1. Mangano; et al. Composition dependent separation of oligonucleotides by capillary electrophoresis in acidic buffers with application to the quality control of synthetic oligonucleotides. Journal of Chromatography A, 1999, 848, 435–442 

2. Zimmermann; et al. Synthetic oligonucleotide separations by mixed-mode reversed-phase/ weak anion-exchange liquid chromatography, Journal of Chromatography A, 2014, 1354, 43–55 

3. Mustonen; et al. Oligonucleotide-based pharmaceuticals: Non-clinical and clinical safety signals and non-clinical testing strategies, Regulatory Toxicology and Pharmacology, 2017, 90, 328–341

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