使用高分辨质谱进行蛋白亚基的分析是生物药开发过程中常用的分析技术。相对于完整蛋白分析，蛋白亚基在色谱上更容易获得好的分离效果，质谱分析的灵敏度也更高。近年来，随着质谱分辨率的不断提升，在蛋白亚基分子量测定时获得同位素峰分辨率能提高定性分析的准确度。 SCIEX X500B QTOF是专门为生物药表征而设计的高分辨质谱平台，在完整蛋白分析、亚基分析以及肽图分析等生物药分析流程方面均能获得高质量的数据。在本技术文档中我们将展示使用SCIEX X500B QTOF高分辨质谱进行Ides酶切后抗体的亚基分子量分析，对于分子量相近的蛋白或者蛋白亚基分子量测定时能获得同位素峰的分辨，我们将展示如何优化质谱以及数据处理参数获得高质量的数据结果 。