随着蛋白质组学的不断发展，蛋白质组学已广泛深入到生物学研究的各个领域，目前，蛋白质组学研究已经由传统的大规模鉴定逐步转向了靶向蛋白质组学，研究内容已经由蛋白质鉴定扩展到了蛋白质相对和绝对定量，对复杂样本中蛋白质的相对与绝对定量有助于发现疾病的生物标志物，对于研究各类疾病的发生与发展有着重要的意义。

　　基于质谱的蛋白质组学定量方法主要有SILAC，TMT，iTRAQ 以及应用三重四级杆的MRM 等，本文主要介绍了赛默飞世尔新一代台式高分辨质谱仪Q-Exactive 在目标蛋白质定量方面的应用。结果显示Q-Exactive 不仅可以在ng级上样量情况下达到98% 以上的蛋白质氨基酸序列匹配度，同时应用target ms2 方法，可以很好的对复杂样本中目标蛋白质进行绝对定量，其定量下限达到了amol，动态范围达到了6 个数量级，且线性相关系数在0.99 以上。