[青莲快讯] 青莲百奥和蛋白质科学中心·北京联合打造BioLadder云平台重磅上线!

2023-8-28 11:22

BioLadder目前上线了生物学分析常用的30多个模块,主要包括以下四类:

  • 数据可视化:箱线图,南丁格尔玫瑰图,韦恩图,UpSet图,饼图,词云图,核密度图,小提琴图,弦图等
  • 组学数据分析:序列的多重比对,表达数据的CV曲线图,PCA,T-SNE,热图,相关性热图等,趋势分析的mFuzz,差异分析的火山图,富集分析的气泡图,修饰位点上下游模体分析的seqLogo,Motif热图等
  • 功能分析:GOPlot,相互作用网络图
  • 数据预处理:长宽表互换等

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BioLadder特色展示

BioLadder除了功能上提供了目前生物数据分析常用的模块外,各个模块在设计的时候也兼顾以下特色:

01

轻松设置个性化颜色

1.配色方案

部分模块,我们预设了像Lancet,JAMA,Nature等期刊常用的颜色方案供您选择。帮助您画出绚丽多彩的图形。

2.调色板调色:

  可弹出调色板,自由方便进行颜色调整。颜色高度自定义。

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02

人性化帮助

在常用参数旁边增加问号悬浮窗。在不理解参数含义和操作方法时,直接把鼠标悬浮到问号上就可以弹出帮助,不需要再翻阅冗长的说明书了。此外还在上传控件旁边提供了“下载示例”,当您不清楚上传文件的格式时,可以一键下载demo数据查看。

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03

支持常用的生物学数据直接绘图

R语言有些模块需要特定的输入格式,我们提供的“长宽表互换”即是为了满足R语言的需求进行的一些转换。为了生物学研究人员的方便,我们在多个模块内部设置了自动的格式转换,以方便研究人员直接上传手上的数据即可进行分析。

我们以韦恩图为例,常规的画韦恩图,需要输入每组的蛋白名称才能绘图。如果我们想对一个定量表进行分析,将定量值为0的认为没有鉴定到,我们需要逐列筛选,贴到网站上画图,费时费力。为此我们的韦恩图模块除了常规的数据输入外,还支持直接上传生物学数据常见的定量矩阵表的格式,减去了格式转换的繁琐。上传定量表后,程序会自动的将其转换为韦恩图的格式,且转换完的数据支持下载。

04

下载参数可调,随意获取需要的大小、分辨率和格式

分析模块中的主要参数便捷可调,点击提交后即可得到绘图结果。绘图结果可以用右键另存,也可以在“图片存盘参数”中设置不同的格式和参数下载需要的图片。

我们的初衷是搭建一个专业的生物信息在线分析和可视化平台,为广大的科研工作者提供方便、快捷的数据处理、功能分析和可视化作图服务。目前上线的模块能完成生物学研究中常见的分析,对各模块的精心设计使得研究人员能方便使用各模块快速完成数据分析和绘图。BioLadder是由北京青莲百奥生物科技有限公司和蛋白质科学机构·北京生物信息平台联合出品。并于今日公测上线,免费注册,注册后免费使用所有功能。我们欢迎您以任何方式提出您的优化意见,使BioLadder平台成为广大科研工作者的生物信息分析平台!此外,如果您热衷于生物信息分析或数据可视化,我们欢迎您成为BioLadder的之一,您可以通过关注公众号与平台沟通,共同开发出更多好用且好看的可视化工具!BioLadder与您共同成长,陪伴长久,不可或缺。

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