新一代测序依据遗传特征为癌症患者个性化治疗提供了方便，仅少数患者对治疗有显著临床反应。因此，需要新的方法来破解除了肿瘤微环境、癌细胞异质性和细胞间相互作用以外的遗传和表观遗传因素。研究其改变是如何影响肿瘤的生长和治疗反应的。随着技术方法的进步可对以上问题进行全面分析。然而，目前尚无评估尖端技术是否有助于肿瘤临床决策的评判方法。

研究者Mitchell P. Levesque等人2021年1月发表了此文章，介绍了TuPro-观察性试验。这种方法整合了多组学研究，为肿瘤的体外药物反应提供了综合治疗建议，为肿瘤个性化治疗策略提供评判标准。

研究工作流程及设置

TuPro 是一项经批准的观察性临床研究，前瞻性地分析患者肿瘤样本，并评估联合多组学和功能数据是否可以提供证据支持临床决策，并非仅用新兴的诊断技术（数字病理学和靶向 NGS）。TuPro包括患者登记、样本采集、技术平台数据分析与整合、分子研究报告总结的创建和讨论、肿瘤治疗方案的讨论和决定。

图1.Tupro流程图

图2.MRM分析图

该技术用于在3年中收集的240种肿瘤样本，涉及三种癌症适应症：转移性黑色素瘤，转移性上皮性卵巢癌和急性髓细胞性白血病（AML）。TuPro的主要目标是在临床上评估由于额外的生物学见解而导致的其他分子谱分析是否有助于和改善临床决策。

该研究包括两个循环：（1）快速诊断循环；（2）探索性科学循环。

图3 Tupro评估参数图

总 结

TuPro整合了三种肿瘤类型的细胞、分子、空间、功能和临床信息，旨在确定这种深入分析对肿瘤委员会治疗决策的相关性。在癌症诊断领域建立的 TuPro 基础设施有可能在几年内成为常规，就像基因组和外显子组测序现在是研究遗传疾病分子基础的常规测试一样。TuPro 方法可以通过提供新的诊断工具和个性化治疗来改变癌症患者的管理方式，它可能有助于识别新的预后或预测生物标志物和潜在的新药物靶点。

文章标题：The Tumor Profiler Study: integrated, multi-omic, functional tumor profiling for clinical decision support

DOI:   10.1016/j.ccell.2021.01.004

发文期刊：Cancer Cell

IF=26.602

领域：多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组