「青莲聚焦」外泌体新型分离武器震撼登场

2023-8-28 11:38

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想要研究外泌体,首先分离外泌体是必不可少的步骤,外泌体因其特殊结构,在分离纯化方面面临很多挑战。广泛外泌体分离常用的方法是超速离心法,根据细胞、细胞碎片、外泌体的密度和大小不同进行分离,耗时长,多达8-10个小时;免疫亲和方法根据外泌体的特异性进行分离,如CD63, CD81, CD9。同样存在加工时间长(4-20 h)、重现性差等缺点;尺寸排阻法根据外泌体和蛋白溶液粒径大小不同进行分离,这种方法更利于大量外泌体制备,但是由于外泌体浓度较低,不利于后面科研实验研究。

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在这种情况下,迫切需要新的外泌体分离方法,能够快速有效地分离出纯度高的外泌体,因此,我们引进了新型的富集材料TiO2,一种能特异性结合磷脂双分子层囊状结构的新型武器新

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新型分离武器的正确打开方式

液体上样首先使用0.22微米的滤膜过滤,去除细胞碎片和较大细胞外囊泡,然后与TiO2孵育,清洗3次,将外泌体洗脱下来,进行后续实验(电镜、NTA、WB、蛋白组学质谱检测等等)。

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新型分离武器技能描述

1.电镜确证

扫描电镜观察到的TiO2是粒径5微米的球,表面是干净光滑的,与样本孵育之后清洗杂质之后,球表面附着了无数的100nm粒径的小囊结构。经过透射电镜观察确证这些富集到的颗粒有典型的cup-shaped 结构。

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2.免疫确证

使用外泌体表面特异性的抗体,如TSG101、CD81对富集前后TiO2进行免疫荧光实验。如图所示,在TiO2微球的表面观察到较强的荧光信号,在对照组样本中只有很小的荧光。证明TiO2富集到了外泌体并且只有结构完整的外泌体才能被富集。

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3.NTA电镜确证

从TiO2上洗脱下来的外泌体经过了透射电镜和NTA分析,在洗脱液中典型的杯状结构依然完整,表明在分离和洗脱过程中,磷脂双分子层结构依然保留。NTA分析结果显示TiO2分离的外泌体大小分布在65 ~ 235 nm之间,中心位于133nm。

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新型分离武器华山论剑

1.鉴定数量比较

超速离心法和外泌体试剂盒法是市面上常用的外泌体分离方法,将TiO2分离法与其他两种方法进行了多角度的比较。对使用三种方法分离出来的外泌体进行了质谱鉴定,分析发现TiO2法鉴定384个蛋白,远高于其他两种方法(超离228个蛋白,试剂盒252个蛋白),与超离相比,提升了40%的蛋白鉴定率。三种富集方式分别鉴定到外泌体蛋白为307(TiO2), 171 (超速离心)和 187(试剂盒法),TiO2法独有的190个蛋白中有144个蛋白是ExoCarta 外泌体数据库中报道过的外泌体蛋白,127个蛋白定位在外泌体,进一步证明TiO2分离外泌体的可靠性。

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2.蛋白富集比较

对鉴定到的蛋白进行GO分析和DAVID功能聚类分析发现,TiO2鉴定到的蛋白中,外泌体蛋白的富集度,这表明TiO2富集的外泌体纯度高。

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3.常见污染蛋白比较

挑选了18种典型的外泌体标记物,它们是外泌体中常见的前100种蛋白质(ExoCarta)。以超离心得到的相应蛋白量为参考,归一化后,得到18个外泌体标记物数量的对数倍差值。

TiO2法和试剂盒法提取的大多数外泌体标记物的数量明显较高(对数值为正),血清中的污染物,即白蛋白(ALB)、IgG (IGHG1-IGHG4)、IgA (IGHA1和IGHA2)、触珠蛋白(HP)和转铁蛋白(TF),在TiO2富集样品中的含量明显低于试剂盒法和超离样品(图中为负对数值)

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4.回收率和实验时间比较

评估了从血清样本中分离外泌体所需的回收率和分析时间,包括超速离心、密度梯度离心、粒径排阻层析,超速离心,免疫亲和法以及聚合物沉淀法。外泌体回收率在5分钟内达到80%,与已发表的其他方法相比,TiO2法是有效的血清外泌体分离方法。

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结论

综上所述,基于外泌体与TiO2的特异性相互作用的新型分离武器,具有回收率高,重现性好、污染少的优点,它能洗脱分离出完整外泌体结构,也可以直接裂解用于下游蛋白质组分析,与传统的方法相比,基于TiO2的外泌体分离方法是一种简单、快速、高效的血清外泌体研究方法。


领域:多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组