Sanjay Chikarmane:基因组数据改变医疗

2018-5-19 17:48

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医疗和生物信息学领袖期待精准医疗的未来,讨论如何应对大数据

测序成本的大幅下降正促使精准医疗不断接近现实。随之而来的是大量的基因组数据,它们需要尖端的生物信息学才能转化为有用的信息。Illumina企业信息部门的高级副总裁兼总经理Sanjay Chikarmane期待能将大数据转化成智能数据 – 也就是说,在合适的时间,将合适的数据提供给合适的人 – 从而为保健决策提供信息,增进保健决策。

Chikarmane在5月的圣地亚哥大数据高管论坛上发言,认为只有当你理解大数据,结合背景并能够从中做出明智的决策时,大数据才有意义。Illumina正利用其全面的基因组学软件方案BaseSpace Informatics Suite来应对这些挑战。

“从这一激增的数据中获得生物学相关信息的能力还存在许多挑战 – 从存储和计算到确定特定突变,以及将这些数据转化成有用的信息”, Chikarmane解释说,我们已经设计出一个自动化的解决方案,可加快从初始样品中获得答案的过程,以便帮助专业人士做出由数据驱动的决策。”

在Biocom主办的峰会上,Chikarmane加入了一个由生命科学和医疗保健行业高管组成的小组,包括Kaiser Permanente、Amazon Web Services和IBM。本次峰会召集各路领袖来集中讨论企业如何能够有效地管理、保护和利用基因组数据和信息。本次活动的重点是在最佳实践上,讨论了围绕数据处理、保护和隐私,满足行业规范和法规,以及计算和存储的策略和技术。

小组一致同意,对于有益的数据,它必须是可访问、可使用、可操作且共享的。他们还将合作定义为一个关键的机会,因为信息共享将对精准医疗行动的成功至关重要。

“最大的机遇是跨学科的合作,跨领域和行业的合作,”Kaiser Permanente的首席信息官John Mattison博士谈道。

圣地亚哥在高性能计算、预测分析和软件开发上的专长,再加上它在基因组学、脑科学、生物技术和数字健康上不容置疑的领导地位,让这一区域在这个数据—生物学交汇点上独占鳌头。

Mattison博士补充说,“我的理念是让你所从事的技术与邻近的技术发展个人关系,并找到你认为可以建立长期信任关系的人,这样才能实现最成功的合作。”


领域:基因/基因组/测序