iTRAQ/TMT-定量蛋白质组学 - 最新推荐

2020-4-19 02:25

1587234170774593.jpg多层组学定制创伤性脑损伤又叫TBI，是由于直接或者间接的机械力作用于脑引起的颅内的损伤。TBI是一种危机生命的综和临床综合症，可引发肺、肝、肾或肠等外周器官功能障碍。本文通过研究TTM（目标温度管理）对TBI的调节及相关机制，提供了TBI脑蛋白质组信息，为进一步评估与TTM相关的候选分子奠定基础。

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创伤性脑损伤又叫TBI，是由于直接或者间接的机械力作用于脑引起的颅内的损伤。TBI是一种危机生命的综和临床综合症，可引发肺、肝、肾或肠等外周器官功能障碍。本文通过研究TTM（目标温度管理）对TBI的调节及相关机制，提供了TBI脑蛋白质组信息，为进一步评估与TTM相关的候选分子奠定基础。

文章名：基于iTRAQ的定量蛋白质组学揭示目标温度管理用于治疗创伤性脑损伤的新证据

材料：细胞系、大鼠模型

主要技术：iTRAQ

期刊： Neurotherapeutics 

影响因子：5.719

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本研究旨在通过定量蛋白质组学技术探讨目标温度管理（TTM）对创伤性脑损伤（TBI）的调节及相关机制。使用细胞损伤控制器（对SH-SY5Y和HT-2CIC）2细胞进行中度拉伸损伤，然后在TTM（亚低温，32℃）或常温（37℃）下孵育。评估实时形态变化、细胞周期相分布、细胞死亡和细胞活性。可控性皮质撞击仪（CCI）产生中等程度TBI，并且在体内测定TTM对神经损伤、神经变性、脑血管组织病理学和行为结果的影响。结果显示，TTM治疗可预防脑内TBI诱导的神经元坏死，在体外和体内减少神经元死亡，减少皮质损伤体积和神经元丢失，减轻脑血管组织病理学损伤和脑水肿并改善行为结果。通过iTRAQ技术鉴定了与TTM调节TBI相关的蛋白质。四种候选分子（纤溶酶原[PLG]，抗凝血酶III [AT III]，纤维蛋白原γ链[FGG]，转甲状腺素蛋白[TTR]）的变化在TBI大鼠脑组织及TBI人脑髓液中得以验证。本研究首次调查了在TBI人蛋白质组和TBI动物模型中TTM的神经保护作用，提供了TBI脑蛋白质组信息，为进一步评估与TTM相关的候选分子奠定基础。1587234170214386.png1587234170172030.png

                                                                 体外实验:TTM克服TBI诱导的神经元坏死1587234171447964.png 

                                                  体内实验:TTM减少神经损伤并减轻TBI后的神经变性 

1587234171258768.png                                                   体内实验:TTM减弱TBI导致的脑 血管组织病 理学并改善行为结果1587234171498317.png1587234171978552.png                                                                                iTRAQ差异比较     1587234172808747.png                                                                         生物信息学1587234172622289.png                                                                                      抗体验证候选蛋白1587234172736146.png

本文为iTRAQ技术在脑科学研究中的应用。研究思路比较典型，通过细胞系体外实验及大鼠模型体内实验，证实目标温度管理对创伤性脑损害的调节效果。在蛋白质组学实验中，评价了CCI+TTM、CCI+37度、对照大鼠+TTM以及对照大鼠+37度共四组实验间的差异，此时iTRAQ技术最为适合，同时检测四组样本且定量结果更为准确。此外本文优点是研究较为全面，从功能实验到蛋白质组学实验及数据分析，最后到候选蛋白的验证都有完成。

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Cheng SX. et al. iTRAQ-Based Quantitative Proteomics Reveals the New Evidence Base for Traumatic Brain Injury Treatedwith Targeted TemperatureManagement. 2018, Neurotherapeutics.

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上海鹿明生物科技有限公司（前身：成立于2009年的上海博苑生物科技有限公司），一直专注于生命科学和生命技术领域，是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多，层组学整合实验与分析的团队。经过近10年的发展沉淀，公司建立起了 Labelfree、iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白组学技术平台和全谱代谢组、靶向代谢组拟靶向代谢组、脂质组等代谢组学技术平台以及相应的数据整合分析平台，并建立了科学完整的服务流程和精细规范的操作标准。迄今为止，鹿明完成服务项目上万个，涉及医学、农业、生态学及工业应用等多个研究领域，发表SCI论文数百篇。

2017年6月，公司与上海欧易生物医学科技有限公司实现战略整合，实现中心法则上中下游多层组学的串联，整合后的鹿明力求打造一流技术平台，争做一流蛋白代谢服务企业，助力生命科学领域的科学家快出成果，出好成果，从而推动科技创新。

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领域：蛋白/抗体/蛋白质组

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