技术介绍 | 一文读懂肠道菌群非靶标代谢组学

2021-4-23 10:53

人体内肠道微生物数量高达100万亿个,接近自身细胞总量的10倍,是人体的“第二基因组”,也被称为“人体另一个器官”。大量研究表明肠道菌群与糖尿病、肝脏疾病、心脑血管疾病、肾病、艾滋病、肿瘤等多种疾病密切相关,在人类健康和疾病中发挥着至关重要的作用。

肠道菌群通过产生的代谢物对人体产生影响。运用代谢组学检测肠菌代谢物的动态变化,清晰展示肠道菌群在宿主中的代谢状态,可更加直观的研究肠道菌群与疾病发生发展的关系,从而为疾病的预防和治疗,提高宿主的健康水平提供新的思路。通过KEGG、BIOML、CGR、HBC、GMrepo等数据库结合文献及宏基因组深度测序数据,Biotree自主构建了肠道菌群代谢组数据库,覆盖2800+个菌株,1200+个肠道菌群相关代谢物,不仅可有效对代谢物进行溯源分类,而且代谢物可精细溯源到具体菌株(部分为种属),将大大助力肠道菌群与健康作用机制研究。

1.技术优势

  • 覆盖2800+个菌种,1200+个肠道菌群相关代谢物,代谢物数量、菌株数量庞大;

  • 不仅可对众多物种的代谢物进行溯源分类,而且代谢物可以溯源到菌株;

  • 代谢物可以确定上下游关系(如果是可逆反应则无)及调控基因/酶。

2.技术路线

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3.技术参数

  • 样本要求

粪便、肠道内容物 200 mg/sample

血清、血浆 200 μL/sample

培养液 ≥200 μL/sample(推荐0.5mL/sample)

  • 检测平台

UHPLC-QTOF-MS/UHPLC-QE-MS

4.应用方向

  • 肠道菌群代谢物动态变化研究;

  • 肠道菌群差异代谢物筛选;

  • 肠道菌群在疾病发生发展中的作用机理研究。

5.案例分析

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6.延伸阅读

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领域:细胞生物学,微生物,生理生态,分子生物学,蛋白/抗体/蛋白质组,基因/基因组/测序,多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组,其他生命科学

标签:肠道菌群非靶标代谢组学