基因组中同义密码子的使用频率存在差异，这一现象被称为密码子使用偏好。基因表达水平与密码子使用偏好之间的正相关关系已被广泛报道。传统观点认为，对翻译速率和翻译准确性的自然选择导致了这一相关关系。然而，另一种可能的机制——密码子使用偏好对mRNA水平的调控作用却被长期忽略。

　　中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究组在酵母中合成了3556个GFP和523个TDH3的同义密码子突变体，发现同义密码子的使用可以调控mRNA水平，并且通过进一步实验表明这一调控可能是通过影响mRNA的降解速率来实现。研究人员进一步分析发现，单个同义突变就可以对mRNA水平产生影响，并且这种影响受到周围序列特性的调控。

　　该研究揭示了同义密码子使用的多效性，为进一步解析密码子使用偏好的进化奠定基础。

　　上述研究成果于8月24日在线发表于Molecular Biology and Evolution（DOI: 10.1093/molbev/msx229）。钱文峰研究组博士研究生陈思羽为该文章的第一作者。该研究得到了国家自然科学基金委的资助。

　　密码子使用偏好调控mRNA水平