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透射式电子显微镜（简称透射电镜）由四部分组成，即电子光学系统（即镜筒）、真空排气系统、电源系统和水冷系统。
电子光学系统包括：照明系统、样品室、成像系统和观察记录系统。
真空排气系统包括：机械泵、油扩散泵、真空管道、阀门及检测系统组成。 电源系统包括：主要的电源供给包括高压电源、电子枪灯丝电源、控制极电源、透镜电源、真空系统电源等部分。
水冷系统主要靠冷却水循环装置来完成或者直接用自来水降温。
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