共聚焦激光显微内镜的使用时间还比较短，与普通内镜和显微镜几十和上百年的发展历史相比，只有短短十来年的时间。但在临床研究和时间方面已经取得了一定的证据，证据支持最多的包括Barrett食管的筛查和诊断，食管鳞状上皮内瘤变和早癌的诊断，胃早癌和癌前病变的诊断，溃疡性结肠炎的诊断以及相关瘤变的随访，结肠息肉的鉴别诊断，消化道进展期癌的分型诊断等等。尤其是肠上皮化生和结肠腺瘤的诊断，诊断精度基本接近病理诊断。随着使用经验的增多，和更多临床证据，对于部分病变，基本可以省略活检的步骤，直接决定治疗方案。对于多发病变，还可以指导活检，减少不必要的活检次数，达到精准活检的目的。
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