大多数商业共定位分析软件都能计算上面所描述的参数，包括 Pearson′s 相关系数、总 overlap 系数以及 k(X)， m(X)和 M(x)共定位系数。此外，许多分析软件包含的算法可进行背景校正，产生整幅图的散点图，且可在一个双通道合成图或共聚焦图的感兴趣区域进行计算。从这些软件中获得的最重要的数据就是共定位系数，这意味着信号之间重叠的相对程度。例如，通道 1 的荧光团共定位系数为 0.75 意味着通道 1 中含有通道 2 组分的强度值占通道 1 总的强度值是 75%。这是一个相对比较高的共定位程度。同样地，对通
道 2 共定位系数为 0.25 意味着明显降低的共定位。
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