琼脂糖凝胶电泳仪是以琼脂糖凝胶作为载体的电泳，广泛用于核酸的研究。琼脂糖凝胶的性能指标有电渗、胶凝温度、熔化温度、凝胶强度和脱水收缩作用等。
一、电渗：
电渗是琼脂糖凝胶电泳中由多糖骨架上的带电基团引起的，主要是由硫酸酯和丙酮酸盐引起，这些阴离子基团被固定在载体中，相应的阳离子与其结合水一起向负极移动。
二、胶凝温度：
将琼脂糖凝胶在溶液中加热至90℃溶解后降温，由液态转变为固态时的温度即为凝固点，称为胶凝温度。
一般在35～43℃。
三、熔化温度：
将凝固的琼脂糖凝胶由固态转变为液态时的温度即为熔化点，称为熔化温度。
一般在75～90℃。
四、凝胶强度：
凝胶强度是指每平方厘米的琼脂糖凝胶所能承受的重量。
凝胶强度与凝胶浓度成正比。
五、脱水收缩作用：
脱水收缩作用是指由于琼脂糖凝胶骨架收缩使一部分液体从凝胶中分离出来的现象。
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