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根据废水中所含主要污染物的性质，可以分为有机、无机及生物实验废水。
有机实验废水包括常用的有机试剂和有机样品，如酚、苯、硝无机实验废水主要含有强酸、强碱、重金属、砷化物等。
生物实验室废水多来自于生物安全实验室，污染物包括培养液，培养基及实验室检验的液体生物标本，如血液、尿、痰液、呕吐物等，还有少量实验器皿及动物笼冲刷水。其污染物以致病菌为主，不含
重金属离子，可生化性好，病原微生物含量大。
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