玉米淀粉可以分为蜡质玉米淀粉、普通玉米淀粉、高直链玉米淀粉，这主要是根据玉米淀粉 的组成部分直链淀粉的差别决定的。在以往的试验中，得知蜡质玉米淀粉的支链淀粉含量在95%以上，而普通的玉米淀粉其直链淀粉的含量在22%~28%之间，高直链玉米淀粉的含量保持在55%以上，所以不同直链淀粉含量其玉米淀粉结构和理化性质也存在差异。对于玉米淀粉的直链淀粉的含量可以利用直链淀粉检测仪进行测定。
分子质量是淀粉结构重要参数之一。直链淀粉和支链淀粉比例会影响玉米淀粉分子质量。直链淀粉相对分子质量比支链淀粉小很多；所以随直链淀粉含量增加，玉米淀粉分子质量逐渐减少。研究表明，玉米淀粉重均分子质量和数均分子质量都满足，依次为：蜡质玉米淀粉＞普通玉米淀粉＞G50高直链玉米淀粉（直链/支链比为1∶1）＞G80高直链玉米淀粉（直链/支链比为4∶1）。同时得出，蜡质玉米淀粉构象是较紧密无规则卷曲，普通玉米淀粉、G50和G80高直链玉米淀粉均为球形，且致密程度依次为：G80高直链玉米淀粉＞G50高直链玉米淀粉＞普通玉米淀粉。
对高直链玉米淀粉、蜡质玉米淀粉和普通玉米淀粉进行粒度分布实验。通过分析粒度分布图表明，普通玉米淀粉和蜡质玉米淀粉粒度分布情况（包括：径距、比表面积、表面积平均粒径、体积平均粒 度等）基本相同，粒径最大值与最小值差距较小；而高直链玉米淀粉上述参数比另外两种玉米淀粉大，且粒径最大值与最小值差距也较大，粒径分布相对较均匀。通过对十种普通玉米淀粉研究发现，淀粉直链淀粉含量与平均粒径成正相关；在此研究中，直链淀粉含量范围为26.5%~30.26%，平均粒径为 14.76~16.64%。
通过直链淀粉检测仪对不同直链淀粉含量的玉米淀粉进行原淀粉的消化速度的分析发现，蜡质玉米淀粉一般大于普通的，又大于高直链淀粉的玉米淀粉，从这其中可以总结出直链淀粉含量 高的淀粉消化速度比较低。其中，蜡质和普通玉米淀粉RDS和SDS含量远远超过高直链玉米淀粉，且蜡质玉米淀粉RDS和SDS含量稍微高于普通玉米淀粉。RS含量顺序为：高直链玉米淀粉＞普通玉米淀粉＞蜡质玉米淀粉；其中前两者差距较大，后两者差距较小。
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