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DNA的定量

2019.11.13
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184****5725

致力于为分析测试行业奉献终身

一、 实验原理

核酸分子(DNA或RNA)由于含有嘌吟环和嘧啶环的共轭双键,在260 nm波长处有特异的紫外吸收峰,其吸收强度与核酸的浓度成正比,这个物理特性为测定核酸溶液浓度提供了基础。

1 OD260相当于dsDNA 50 ug/ml,ssDNA 33 ug/ml和ssRNA 40 ug/ml。可以此来计算核酸样品的浓度。

紫外分光光度法不但能确定核酸的浓度,还可通过测定260nm和280nm的紫外线吸收值的比值(A260/A280)估计核酸的纯度,纯的DNA制品的比值为1.8,RNA的比值为2.0, 若DNA高于1.8,则可能有RNA污染,低于1.8则有蛋白质污染。

对于很稀的核酸溶液,可用荧光光度法进行测定。DNA 本身并不产生荧光,但在荧光染料溴化乙锭(EB)插入DNA 的碱基对平面之间并与之结合后,DNA样品能在紫外光的激发下产生桔红色荧光。荧光强度与被结合的EB的量成正比,而被结合的EB的量又与核酸分子长度和含量成正比,使用一系列已知的不同浓度DNA溶液作标准对照,可比较出被测DNA溶液的浓度。灵敏度可达1~5ng。由于是基于目测,所以是估计水平。 该方法经济简便,但准确性较低。

二、仪器及试剂

1. 仪器:Amersham GeneQantTM Pro 紫外可见分光光度仪,琼脂糖凝胶电泳设备。

2. 试剂及配制:

5×上样缓冲液:配制10 ml
0.5 mol/L EDTA(pH8.0) 2 ml
10% SDS 50 ul
50% 甘油 2.5 ml
0.2% 溴酚蓝 10 mg
0.2% 二甲苯青FF 10 mg
加去离子水至10 ml

其它试剂:0.1×TE 、DNA标准液,EB储存液(10 mg/ml),

三、实验步骤

1.紫外分光光度法

(1)用0.1×TE对待测DNA样品按1:20或合适的倍数稀释。

(2)开机,仪器会自动对光路及分析软件进行检测,待显示屏上出现“instrument Ready”时,进入核酸测定窗口

(3)调零。先用0.1×TE缓冲液注入样品杯,放入样品槽,关闭盖板。点击“set ref”键,仪器自动校正零点。将样品槽内的样品杯取出,换上待测样品。

(4)吸70 ul已稀释的DNA样品转入石英样品杯,放入样品槽,关闭盖板。如果样品很少,可以用5~7ul的石英样品杯。点击“enter” 键,仪器即进入分析状态。窗口同时显示260和280nm处的光密度(OD值)及260/280nm和280/260nm的比率以及DNA样品的浓度等。

(5)打开盖板,取出石英样品杯,吸出样液,用高纯水清洁石英样品杯,风干后,再加入下一个待测样品。

(6)DNA纯度:以OD260/ OD280比值来反映。当OD60 /OD80比值 <1.8时,说明样品存在蛋白质或酚等杂质,可采用平衡酚/氯仿/异戊醇再抽提除去蛋白质或用乙醚抽提去除残留酚,再用无水乙醇沉淀,TE悬浮后再测定。当OD60/OD280比值>2.0,说明样品存在RNA污染,可以用RNA酶处理样品去处RNA 。


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