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小鼠基因组DNA抽提操作规程

2019.11.13
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184****5725

致力于为分析测试行业奉献终身

一、原理与意义

先用细胞裂解液对已制备好的组织匀浆充分裂解,然后用蛋白酶去除其中的蛋白,再用氯仿一次抽提(无需用酚抽提)、预备液沉淀、RNase去除RNA、乙醇再沉淀即可得到完整DNA。该方法适用于从人或动物的各种组织、血液、培养细胞、G+/G-细菌中快速抽提基因组DNA。抽提出来的DNA能用于几乎所有的分子生物学实验,如DNA梯度分析、PCR、限制性内切酶反应、克隆、Southern Blot分析等。

二、试剂及其配制

抽提试剂盒购于上海生工公司,内含以下试剂:

1、TE缓冲液:PH8.0,由10 mM Tris HCl和1 mM EDTA配成。

2、RNase A(3 mg):使用前加入300 ul无菌双蒸水,煮沸10 min后使其自然冷却后使用,-20 ℃冻存。

3、Proteinase K(12 mg):使用前加入600 ul无菌水,分装成小份,-20 ℃冻存。

4、Cell Lysis Solution与Precipitation Solution:溶液出现絮状沉淀50 ℃加热溶解后使用。

5、1.2 mol/L NaCl。冰冷乙醇和氯仿自备。

三、实验器材

水浴锅、普通冰箱、1.5/2 ml离心管、移液器及枪头、紫外分光计、离心管架、剪刀、镊子、滤纸等。

四、操作步骤

1、组织匀浆制备:取30 mg左右新鲜组织,加600 ul TE缓冲液,手工匀浆数次。

2、细胞裂解:吸取300 ul匀浆加600 ul Cell Lysis Solution,混匀。

3、消化蛋白:再加入9 ul Proteinase K(可适当增加)混匀,置于55 ℃水浴30 min以上(可达2.5 h),其间上下混匀几次。

4、氯仿抽提:加入600 ul氯仿(用户自备),轻柔上下混匀,不能太剧烈,以保证DNA的完整性。

5、沉淀:在台式离心机上,10000转/分,室温离心2 min。此时应分成三层,基因组DNA在上层中,如未能分层,表明样品与氯仿未混匀(可通过延长离心时间或增加离心速度获得上清)。取500 ul上清液,置于无菌1.5 ml离心管中,加入500 ul Precipitation Solution,混匀多次至出现絮状物,室温静置2 min。10000转/分,离心2 min。

6、去除RNA:弃除上清,注意不要倒掉沉淀,立即加入100 ul 1.2 mol/L NaCl,轻轻振荡直至DNA样品完全溶解,加入3 ul RNase A,置于37 ℃ 10 min,以去除RNA。

7、沉淀DNA:加入300 ul冰冷乙醇(终浓度为75%,沉淀效果最佳),-20 ℃放置10 min。10,000转/分,离心2 min。倒掉乙醇,倒置室温干燥10~15 min。若DNA量多,可再重复沉淀一次。DNA用TE缓冲液或100 ul三蒸水溶解。

五、注意事项

1、应避免多次冻融样品,因为每次冻融都大大降低完整DNA的产率。

2、加氯仿充分混匀,若离心后上清不到500 ul,可适当延长离心时间或增加离心速度。

3、吸取DNA上清时,可用剪刀稍剪枪头尖部,以防止虹吸现象。

4、操作步骤中许多数值可进行成比例改变,如上清与预备液按1:1,氯化钠与无水乙醇按1:3等。

5、转录活性很高的组织或细菌中通常含有大量的RNA,他们可能与DNA一起被分离出来。RNA的存在并不影响PCR反应。如果需要制备RNA-free的基因组DNA。可在第6步加入200 ul的RNase A,37 ℃保温10 min即可。

6、用分光光度计测量DNA含量按1 OD260=50 mg基因组DNA;进行0.7%琼脂糖凝胶电泳判定DNA的完整性,也可以判定样品中是否有RNA。本试剂盒可抽提长抵达50kb以上的DNA。一般在DNA样品,OD260/OD280比值大于1.8,可能存在RNA;OD260/OD280比值小于1.6,可能存在蛋白质或酚。但RNA样品中OD260/OD280比值小于2可能存在蛋白质或酚,均需要进一步纯化。

7、通常50ul体系PCR反应中用1~5 ul DNA。


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