⑴ U1-nRNP抗体（U1-nRNP）
为夏普综合征的特征性的标志。夏普综合征为多症状多表型的混合结缔组织病合并有类风湿性关节炎、SLE、系统性硬化症及多肌炎的临床特征。抗U1-nRNP抗体也可见于SLE，系统性硬化症和多肌炎。
⑵ 抗SM抗体（SM）
抗SM抗体对SLE高度特异超过90%，同抗dsDNA抗体一起，都被认为是参与疾病的致病过程。
⑶ 抗SS-A抗体（SS-A）
抗SS-A抗体与各种自身免疫疾病相关。最常见于干燥综合征，但也可见于SLE及原发性胆汁硬化症，偶见于自身免疫性肝炎及病毒性肝炎。SS-A特别见于新生儿红斑狼疮100%。SS-A与Ro-52的相互鉴别在诊断上十分关键。
⑷ 抗Ro-52抗体（Ro-52）
抗Ro52抗体不具有疾病特异性，可在肌炎、系统性硬化症、其他胶原病、新生儿红斑狼疮、原发性胆汁性肝硬化、自身免疫性肝炎及病毒性肝炎中检出该抗体。
⑸ 抗SS-B抗体（SS-B）
SS-B常见于干燥综合征、系统性红斑狼疮及新生儿红斑狼疮。
⑹ 抗Scl-70抗体（Scl-70）
Scl-70可见于25%-75%的硬化症患者，约40%-65%为弥散型皮损，5%-15%为局限型皮损。
⑺ 抗PM-Scl抗体（PM-Scl）
PM-Scl可见于多发性肌炎与系统性硬化症重叠征，PM-Scl通常识别两种主要抗原PM-Scl75和PM-Scl100。如果是进行性系统性硬化症，抗PM-Scl75阳性率为10%，抗PM-Scl100阳性率为7%。
⑻ 抗Jo-1抗体（Jo-1）
Jo-见于多发性肌炎和皮肌炎，阳性率25%-35%，常常与肺间质纤维化或纤维素性肺泡炎相伴发。
⑼ 抗着丝点抗体（CENP B）
CENP B与局限型系统性硬化症相关，偶见于系统性硬化症弥散型，亦可见于原发性胆汁性肝硬化。
⑽ 抗PCNA抗体（PCNA）
PCNA常见于系统性红斑狼疮患者。PCNA的特异性高达99%，但其敏感性只有3%。
⑾ 抗dsDNA抗体（dsDNA）
dsDNA主要见于SLE，也偶见于其它自身免疫性疾病和感染性疾病，极少数情况下出现于健康人群。
⑿ 抗核小体抗体（核小体）
抗核小体抗体见于系统性红斑狼疮患者血清中。通过与新型高度提纯的核小体反应，SLE的诊断特异性几乎达到100%。
⒀ 抗组蛋白抗体（组蛋白）
抗组蛋白抗体通常见于药物诱导的红斑狼疮，也可见于非药物诱导的红斑狼疮和类风湿性关节炎患者。
⒁ 抗核糖体P蛋白抗体（糖体P蛋白）
糖体P蛋白为SLE特异性自身抗体。SLE患者中的高滴度糖体P蛋白与疾病活动度不相关，但在其它伴发症状如精神症状的SLE患者中糖体P蛋白检出率更高一些。
⒂ 抗线粒体抗体-M2(AMA-M2)
AMA-M2是原发性胆汁性肝硬化（PBC）最为灵敏、特异的诊断标志。自身免疫性肝炎、进行性系统性硬化症、干燥综合征、与PBC重叠征患者中也可检测到AMA-M2抗体。慢性HCV、系统性红斑狼疮可检测到低浓度AMA-M2抗体。
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