分析型蛋白酶色谱仪种类有多种。
1、按分离目的可分：实验室分析型蛋白酶色谱仪和工业分析型蛋白酶色谱仪。
2、按固定相和流动相的极性大小可分：正相分析型蛋白酶色谱仪和反相分析型蛋白酶色谱仪。
3、按检测器属性可分：质量型检测器分析型蛋白酶色谱仪和浓度型检测器分析型蛋白酶色谱仪。
4、按洗脱方式可分：等度洗脱分析型蛋白酶色谱仪和程序洗脱分析型蛋白酶色谱仪。
5、按应用范围可分：分析型蛋白酶专用色谱仪和分析型蛋白酶通用色谱仪。
6、按分离特征可分：高选择性分析型蛋白酶色谱仪、高灵敏度分析型蛋白酶色谱仪和高分离度分析型蛋白酶色谱仪。
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