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在气液分配色谱仪分析中，载气是情性的，组分在载气中浓度很低，组分分子之间作用力很小，可以忽略。在液液分配色谱仪分析中，组分在流动相中浓度低，组分分子之间作用力也可以忽略。在分配色谱中主要的作用力是组分分子与固定液分子之间的作用力，这种作用力反映了组分在固定液中的热力学性质。作用力大的组分，由于溶解度大，分配系数大。分配色谱仪分析的选择性主要决定于组分和固定液的分子结构及相互作用力的差异。
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