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毛细管高效液相色谱仪分类有多种。1、按分离目的可分:毛细管高效液相实验室色谱仪和毛细管高效液相工业色谱仪。2、按结构可分:台式毛细管高效液相色谱仪和落地式毛细管高效液相色谱仪。3、按分离原理可分:毛细管高效液相吸附色谱仪和毛细管高效液相分配色谱仪。4、按功能可分:毛细管高效液相分析色谱仪和毛细管高效液相制备色谱仪。5、按用途可分:生物色谱仪、制药色谱仪、化工色谱仪、食品色谱仪、医用色谱仪、血液色谱仪、菌体色谱仪、维生素色谱仪、白酒色谱仪、酒精色谱仪、啤酒色谱仪和专用色谱仪等。