液固吸附色谱仪的操作包括装柱、上样、洗脱、检测和收集等步骤。
一、装柱：
装柱是液固吸附色谱仪能否成功分离纯化物质的关键步骤之一。装柱的主要问题是保证固定相在色谱柱中均匀紧凑，不能有气泡和裂痕出现。一般色谱柱的直径与长度比为1：10～1：50，硅胶量是样品量的30～40倍，具体的选择要具体分析。
装柱步骤：
1、关闭色谱柱出水口，装入1/3柱高的缓冲液，将吸附剂缓慢地倒入柱中。
2、打开出水口，控制适当流速，使吸附剂均匀沉降，并不断加入吸附剂，吸附剂的多少根据分离样品的多少而定。注意不能干柱、分层，否则必须重新装柱。
3、最后使柱中的吸附剂表面平坦，并在表面上留有2～3cm高的缓冲液，同时关闭出水口。
二、上样：
上样过程一般要迅速，样品最好用与洗脱剂相同的溶剂溶解，而且必须将上样时可能粘附在柱上层的样品洗到固定相中后，才能再加洗脱剂进行洗脱。
加样时应缓慢小心地将样品溶液加到吸附剂表面，尽量避免冲击吸附剂，以保持吸附剂表面平坦。
上样方法有湿法和干法。湿法一般用洗脱剂溶解样品，也可以用二氯甲烷和乙酸乙酯等，溶剂越少越好。
三、洗脱：
洗脱的关键是选择合适的洗脱溶剂，洗脱剂的选择一般用薄层色谱仪试验多次后确定。
洗脱方式可分为简单洗脱、分步洗脱和梯度洗脱。
1、简单洗脱：
色谱柱始终用同一种溶剂洗脱，直到色谱分离结束为止。
如果被分离组分对吸附剂的亲和力差异不大，其谱带的洗脱时间间隔（或洗脱体积间隔）不长，采用这种方法是适宜的。但选择的溶剂必须很合适，才能使各组分的分配系数差别较大，否则应采用分步洗脱和梯度洗脱。
2、分步洗脱：
用按洗脱能力递增顺序的几种洗脱剂进行逐级洗脱，每次用一种洗脱剂将一种组分洗脱下来。
主要用于混合物组成简单、各组分性质差异较大或需快速分离的场合。
3、梯度洗脱：
梯度是指流动相的浓度、极性、离子强度和pH值等。
当混合物中组分复杂且性质差异较小时，一般采用梯度洗脱。它的洗脱能力是逐步连续增加的。
四、检测：
采用检测器对色谱柱流出组分进行检测。
五、收集：
色谱分离组分在收集之前要进行检测。
一般的检测方法是用荧光薄层色谱仪随时接一滴流出液，吹干溶剂后在紫外灯下看是否有斑点，若有斑点应作为组分收集，直至斑点消失。同样方法操作直至收集完全部组分。
也可采用等体积收集流出的全部流出液，即用收集瓶以10mL或20mL等体积收集从柱中流出的全部流出液，待整个色谱分离完成后，用测定液体折射率和薄层板显色等方法确定收集的流出液是否含有组分，然后合并含有相同组分的流出液。
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