毛细管电泳色谱仪是以毛细管为分离通道，以高压直流电场为驱动力，利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离。毛细管溶液中有电流通过时会产生焦耳热，散热过程中，在毛细管内形成径向温度梯度（中心温度高），破坏了扁平塞子流型，导致谱带展宽。控制焦耳热的方法如下：
一、降低电场梯度：
1、焦耳热成比例降低。
2、柱效和分辨率降低。
二、减小毛细管内径：
1、电流大大降低。
2、灵敏度降低。
3、可能引起样品吸附的增加。
三、减小缓冲液离子强度或浓缩：
1、电流成比例降低。
2、可能引起样品吸附的增加。
四、温度控制：
恒温并有效地转移毛细管中的热量。
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