离子色谱仪常用分离方式有离子交换色谱、离子排斥色谱和离子对色谱。
一、离子交换色谱：
基于流动相中溶质离子和固定相表面离子交换基团之间的离子交换作用而达到溶质保留和分离的离子色谱。
固定相是低容量的离子交换树脂（0.01～0.5mmol/g）。
二、离子排斥色谱：
基于溶质和固定相之间的Donnan排斥作用的离子色谱。
固定相是高容量的离子交换树脂（3～5mmol/g）。
三、离子对色谱：
基于溶质离子和流动相中的离子对试剂形成电中性的离子对化合物后，通过吸附与分配等相互作用在固定相中保留和分离的离子色谱。
固定相是用不含离子交换基团的多孔树脂。
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