色谱仪基本选型原则是根据样品的相对分子质量、溶解性和分子结构等选型。
一、根据相对分子质量选择：
相对分子质量＜200，挥发性强，加热不易分解的样品，可选择气相色谱。
相对分子质量在200～2000的样品，应视样品性质选择液液分配色谱、液固吸附色谱或离子交换色谱。
相对分子质量＞2000的样品，可选择凝胶色谱。
二、根据溶解性选择：
对于水溶性离子化合物，可选择离子交换色谱。
对于水溶性共价化合物，可选择液液分配色谱。
对于非水溶性化合物，若易溶于烃类溶剂，可选择液固吸附色谱；若溶于二氯甲烷，可选择液固吸附色谱或正相液液分配色谱；若溶于甲醇，可选择反相液液分配色谱。
三、根据分子结构选择：
对于同系物，可选择液液分配色谱。
对于异构体，可选择液固吸附色谱。
含有离子基团或能电离基团的样品，可选择离子交换色谱。
对于生物大分子和高分子聚合物，可选择凝胶色谱。
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