色谱仪定性分析的依据是物质的保留行为，定性分析方法主要有利用物质的保留行为定性、利用化学反应定性、与质谱和红外结合定性等。
一、利用物质的保留行为定性：
1、用已知对照定性：
（1）比较保留值法：在相同色谱条件下，比较样品中各组分与已知物的保留值。
（2）峰高增加法：把已知物加到样品中，看组分峰的增高来定性。
2、利用资料数据定性：
目前资料数据很多，有专著和数据库，有相对保留值、比保留值、保留指数和次甲基单位等形式，其中相对保留值和保留指数zui多。
（1）相对保留值：在相同色谱柱和相同操作条件下，组分的调整保留值与标准物的调整保留值的比值。
（2）保留指数：把物质的保留行为用紧靠它的标准物（正构烷烃）来标定。
二、利用化学反应定性：
包括色谱柱前的预处理化学反应和柱后的化学反应，利用它们帮助确定哪些基团是否存在。
三、与质谱和红外结合定性：
利用色谱的分离能力得到纯的单组分，再利用质谱和红外可确定分子式和基团的能力，以确定分子结构来定性。
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