同位素质谱相对来说作为一个质谱与其他的GC-MS，LC-MS有很大的不同，专注于测定C,H,O,N,S元素转化成的简单气体(包括 N2,CO2，H2，CO，SO2等)的同位素离子。其质量数最大也不超过70。所以同位素质谱指标不在于质量数和分辨率，而在于测试精度，线性范围，灵敏度等重要的参数。
第一为：灵敏度，灵敏度一般说成仪器的最低检测限，就是仪器检测的最少样品量，如几个CO2分子可转变为一个CO2离子，检测器有响应的信号，正常这个值越小越好。
第二为：精度，像参考气体的精度，就是连续的进几次参考气，看其精度为多少，一般这个都没问题。更为关键的是不同仪器联用时候的精度，比如元素分析仪联接同位素质谱的精度，GC联同位素质谱的精度。作为一个联用仪器，每一个部分都很重要，因为最终是反映的是一个整体的性能。测试精度其实就是通常我们说的重现性，只是同位素质谱需要反映微小的差异，在这里就说成精度了。
第三，线性，通常说的就是样品在多大的质量范围内的同位素是一个相对稳定的值，线性范围大，其操作会更加方便，在GC-IRMS中显得更为重要，因为更难计算。
第四、其他，如同时分析离子种类越多越好。
还需要注意的是，每一个仪器部分，在样品准备，进样过程等方面是否可以做到更好，无污染，更简便等。
总结下，质谱关注灵敏度，精度，线性范围，还有外设的稳定性。
选择仪器有以下几个方面：一、价格;二、仪器技术先进性;三、应用服务能力;四：仪器皮实耐用性;五、市场占有率;六、运行成本等。
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