分析测试百科网

搜索

喜欢作者

微信支付微信支付
×

转录组+蛋白组联合,揭示microRNA调控靶点与功能机制 一

2020.4.14
头像

王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时,miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是,miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能,该研究构建了miR-137 KO动物,并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神经功能的损伤进行了评价。借助于转录组+蛋白组联合分析,研究者进一步鉴定出phosphodiesterase 10a(Pde10a)是miR-137的重要调控靶点。

文献小笔记

中科新生命

Partial loss of psychiatric risk gene Mir137 in mice causes repetitive behavior and impairs sociability and learning via increased Pde10a

Nature Neuroscience  IF=19.912

原文链接:https://www.onacademic.com/detail/journal_1000040907544310_8357.html

研究材料与方法

图1

Mir137-knockout mice

(1)评价miR-137KO后神经功能受到的影响:

● 突触可塑性:免疫组化,spinedensities,dendritic length,等

● 学习记忆能力:Morriswater maze test,Barnes maze test,long-termpotentiation (LTP),等

● 重复行为与社交能力:marbleburyingtest,social interaction test,thethree-chamber test,等

(2)蛋白组分析:

● 技术:TMT定量

● 样本:皮层组织

● 组别与重复:Mir137+/+,Mir137+/–, and Mir137–/–,每组两个生物学重复(来自于两窝)

(3)转录组分析:

样本同蛋白质组

(4)转录组+蛋白组联合分析寻找miR-137直接调控靶点:

Sylamer算法比对UTR匹配富集结果与蛋白差异表达的相关性,以及进一步比对mRNA差异表达水平

(5)验证miR-137直接靶点:

luciferase reporter assay,UTR突变

研究内容与结果

1.突触蛋白免疫组化、树突长度等分析,揭示miR-137 KO可导致神经可塑性受损。

图2

Fig. 2 |Loss of miR-137 in the nervous system leads to synaptic overgrowth and impaireddendritic growth in vivo

2.多种行为测试揭示miR-137 KO可导致学习记忆功能失调。

图3

Fig. 3 | Partial loss of miR-137 leads to the learningand memory deficits.

3.多种行为测试揭示miR-137 KO可导致社交能力改变。

图4

Fig. 4 | Partial loss of miR-137 causes impaired socialbehaviors in mice


互联网
文章推荐