图 4Qubit 结果显示: 三种保存管 7 天内保存效果无明显差异, 14 天时, K 组与 S 组保存管均出现明显的上升,分别是第 0 天的 15.27 倍和 10.21 倍, 21 天时,上升最为明显,分别是第 0天的 22.46 倍和 13.84 倍。 B 组保护剂保存的血液在第 0、 3、 7、 14、 21、 28 天检测时, 每毫升血液 cf-DNA 浓度均无明显的上升。
图 5Beta-actin 绝对定量结果与图 4 基本一致。 B2 组保护剂保存的血液在第 0、 3、 7、 14、21、 28 天检测时, 每毫升血液 Beta-actin 拷贝数均无明显的上升。
3.2 不同天数下(4°C)游离核酸保存效果的对比
图 6Qubit 结果显示: 在 4°C 情况下, 三种保存管 0-14 天的每毫升血液 cf-DNA 浓度并无明显的差异。
图 7Beta-actin 结果显示:在 4°C 情况下,三种保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin 拷贝数并无明显的差异。
3.3 不同天数下(37°C)游离核酸保存效果的对比
图 8Qubit 结果显示:在 37°C 情况下,三种保存管 0-14 天的每毫升血液 cf-DNA 浓度并无明显的差异。
图 9Beta-actin 结果显示:在 37°C 情况下,三种保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin拷贝数并无明显的差异。
3.4 运输环境(25°C)对游离核酸保存效果的影响
考虑到保存管有可能应用于样品的长途或短途运输,因此需用摇床模拟运输环境对保护剂抑制细胞破裂的影响。 S 组、 K 组及 B 组分别采集血液一份,摇床设置 180rpm, 25°C,分别在 0、 3、 7、 14 天检测核酸浓度和 beta-actin 拷贝量。
图 10Qubit 结果显示:在 25°C 模拟震荡情况下,三种保存管 0-14 天的每毫升血液 cf-DNA浓度并无明显的差异。
图 11Beta-actin 结果显示:在 25°C 模拟震荡情况下,三种保存管 0-14 天的每毫升血液Beta-actin 拷贝数并无明显的差异。
4.讨论
(1)从每毫升血液 Beta-actin拷贝数及每毫升血液 cf-DNA浓度两个方面来验证 cf-DNA完整性,已在多篇文献中[4][5]得到验证。
(2) 室温 25°C 下,保存 3 天时, 3 种保存管的差异不显著;保存第 7 天时, E 与 B 组间的差异极显著, B 与 S
组差异具有显著性;保存第 14 天时, B 与 S 组 P value<0.01,差异极显著。 在室温 25°C 下, B 组较 S 组及
E 组,保存时间较长,效果较佳。
(3)室温 25°C 下,三种保存管 7 天内保存效果无明显差异, 14 天时, K 组与 S 组保存管均出现明显的上升,, 21
天时,上升最明显。 B 组保护剂保存的血液在第 0、 3、 7、 14、 21、 28 天检测时,每毫升血液 cf-DNA 浓度均无明显的上升。
在室温 25°C 下, B 组较 S 组及 K 组,保存时间较长,效果较佳。
(4)在 4°C 情况下,三种保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin 拷贝数及每毫升血液 cf-DNA浓度并无明显的差异。 在 4°C 下, B 组、 S 组及 K 组,保存效果无明显差异。
(5)在 37°C 情况下,三种保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin 拷贝数及每毫升血液 cf-DNA浓度并无明显的差异。 在 37°C 下, B 组、 S 组及 K 组,保存效果无明显差异。
(6) 在 25°C 模拟震荡情况下,三种保存管 0-14 天的每毫升血液 Beta-actin 拷贝数及每毫升血液cf-DNA 浓度并无明显的差异。 在 25°C 模拟震荡情况下, B 组、 S 组及 K 组,保存效果无明显差异。
5.参考文献
[1]MANDEL P, MéTAIS P. Les acides nucléiques du plasma sanguin chez l’homme [J] . C R Acad Sci Paris, 1948,142: 241-243.
[2]LEON S A, SHAPIRO B, SKLAROFF D M, et al. Free DNA in the serum of
cancer patients and the effect of therapy [J] .Cancer Res, 1977, 37(3):
646-750.
[3]STROUN M, ANKER P, MAURICE P, et al. Neoplastic characteristics of
the DNA found in the plasma of cancer patients[J] . Oncology, 1989,
46(5): 318-322.
[4]Norton S E, Lechner J M, Williams T, et al. A stabilizing reagent
prevents cell-free DNA contamination by cellular DNA in plasma during
blood sample storage and shipping as determined by digital PCR[J].
Clinical Biochemistry, 2013, 46(15):1561-5.
[5] Ryan W L, Fernando R M, Das K. BLOOD COLLECTION DEVICE FOR STABILIZING CELL-FREE PLASMA DNA:, WO 2013123030 A3[P]. 2013.