生物芯片技术发展较早，始发于上个世纪80年代，起初的激素是将寡核苷酸固定在载体上，然后通过核酸杂交技术来检测未知序列，后来随看人类基因组计划的兴起得到了迅速发展。目前，生物芯片不但包含发展之初的核酸芯片还有蛋白质芯片，已发展成为一门工艺及市场化都相当成熟的技术。

而微流控芯片的发展始于上个世纪90年代，是在分析化学领域，而不是在基因工程领域里首先发展开来的。它是将分析化学、微机电加工、计算酿学等结合起来，主要应用于生命科学，在芯片上实现实验室的全部功能，具有广阔的适用性和美好的应用前景。微流控芯片和生物芯片二者之间的关系不是相互包含而是相互补充，相互融合，都为了实现芯片实验室的功能。

最初，微流控芯片只是作为纳米技术革命的一个补充，然而却在经历了大肆宣传及冷落的不同时期后，却实现了商业化生产。微流控分析芯片最初在欧洲被称为“微整合分析芯片”（micrototal analytical systems），在美国被称为“芯片实验室”（lab-on-a-chip），随着材料科学、微纳米加工技术和微电子学所取得的突破性进展，微流控芯片也得到了迅速发展，但还是远不及“摩尔定律”所预测的半导体发展速度。今天阻碍微流控技术发展的瓶颈仍然是早期限制其发展的制造加工和应用方面的问题。