微流控芯片是在一块几平方厘米的芯片上构建的一个生化实验室，它以微机电加工技术(MEMS)为基础，在硅片、玻璃或聚二甲基硅氧烷(PDMS)等材料上制造微管道，并由微通道形成网络，以可控流体贯穿整个系统，实现生物和化学领域中所涉及的反应、分离、检验、细胞培养等基本操作，用以取代常规生物或化学实验室的各种功能，因此也被称为“芯片上的实验室(Lab-on-a-chip)”。
由于微流控芯片采取微通道结构，要求对极低浓度试剂进行检测，并逐步提出对单个分子进行检测，要求微流控芯片检测仪具有很高的灵敏度、信噪比、反应速度。因此为了提高信噪比，在光路设计优化之外，设定特定波长的滤光片、选择适当大小直径的针孔、对所有部件特殊处理等对检测中可能发生的杂散光也进行了相应处理;此外微流控芯片检测仪还具有信号放大电路、软件滤波处理等。
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