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有两种类型，一是光学显微镜观察到的显微结构，二是电子显微镜观察到的亚显微结构。
光学显微镜由于受放大倍数和分辨率的限制，观察到细胞中的结构比较局限，可以看到细胞核、叶绿体、液泡等较大的结构的基本形态。
电子显微镜可以观察到更加细致的结构，如线粒体等细胞器的内部结构，细胞膜的大体结构等方面。
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