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Neogen农业基因组学解决方案(三)

2020.6.15
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

猪的基因组学解决方案
GeneSeek 的猪基因组学解决方案为窥探猪的遗传结构打开了一个重要的窗口,包括是否易感染治疗昂贵的疾病以及繁殖中对想要性状的锁定。

GeneSeek猪全基因组低密度微珠芯片
该微珠芯片提供约 10,000个 SNP,包括经常使用的 USDA血统和身份 SNP、用于识别品种的 SNP以及和结构稳定性相关的 SNP。其它性状标记包括:

• 应激综合症基因(HAL)                                     •  红细胞生成素受体—和 子宫容量以及
•  酸肉基因(RN)*                                             同胎生仔数相关
•  大肠杆菌腹泻抗性基因(F4 ab/ac)*                  • 与生长和肉质性状关联的 6 个特定     
•  PRRS抵抗性/耐受性                                             SNP:采食量/饲料转化率/增重/瘦肉
•  雌激素受体基因(ESR)*:对大白猪或长白              率/脂肪含量和肉质。
猪的产仔数性状有较大影响                                     基因:MC4R、HMGA、CCKAR、CAST、PRKAG

*这些选配的、需要许可证的试验需要额外的检测费

猪SNP60微珠芯片
这一微珠芯片包括 64,000多个SNP,遍布猪的整个基因组,可以高效率且高通量检测。

SeekGain性能标记:GeneSeek的猪生产性状测试程序
GeneSeek提供经过验证的猪生产性状 DNA 标记测试,使用的是来自七个独特基因的信息,这
些基因的影响范围如下:

•  摄食量和饲料转化率           •  同胎生仔数
•  增重                                (雌激素受体)
•  精肉增长                          •  同胎生仔数
•  脂肪含量                           (红细胞生成素)
•  肉质

额外试验
GeneSeek还为猪提供众多基因和疾病诊断法,包括:
•  应激综合症基因(PSS)
•  猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)和猪圆环病毒 2 型(PCV2)
•  SeekSire血统测试
•  SeekTrace 来源验证程序
•  大肠杆菌 F4ab/ac 遗传测试

绵羊的基因组学解决方案
绵羊的基因组学测试可以提醒生产商注意一些问题,而如果不进行测试的话,很可能再过几年他们才能发现这些问题。也可用它来为畜群的繁殖做出正确的决定。GeneSeek的绵羊基因组学测试解决方案包括:

•  全基因组选择
•  确定遗传优势
•  识别数量性状基因座(QTL)
•  比较遗传学研究

可用的Illumina基因分型试验
•  绵羊SNP50微珠芯片—54,000多个大信息量的 SNP标记
•  山羊 SNP50 微珠芯片—53,000多个 SNP标记
•  还有定制的微珠芯片

绵羊遗传试验
•  绵羊进行性肺炎病毒            •  羊蜘蛛腿综合征
(OPPV)易感性                   •  肌生成抑制蛋白
•  痒病易感性                        •  SNP 谱系

马和狗的基因组学解决方案
这些遗传检测可以确定马或狗是否具有想要的繁育特性,另外,如果对马或者狗的血统有所怀疑的时候,经过这样的检测证明它们的血统。
•  马 SNP70微珠芯片—70,000 个大信息量的 SNP标记
•  狗 HD微珠芯片—170,000 多个 SNP 标记
• 血统验证—公畜确认

针对研发的基因组学解决方案
GeneSeek为研发提供众多基因组学解决方案,从小鼠到植物基因分型。

小鼠通用基因分型试验

MEGA小鼠通用基因分型试验(MUGA)提供 76,000 个根据Illumina Infinium 平台建立的SNP标记。
这些SNP 标记分布于整个小鼠基因组。为了让这些基因分型结果能够得到最高效的应用,实验设计让每一个被测试的SNP都独立的提供了最大量的标记信息。

Mega MUGA的设计标准优化了杂合子区域的检测以及纯合子区域内单倍型之间的区分。该实验的等位基因频率和单倍型是从八个实验室小鼠品系得出的,这些品系是基因交互协作的基础。

定制基因分型微珠芯片
有了这些微珠芯片,便可查询几乎任何物种的任何SNP。Infinium微珠芯片化学技术的高度重复性和灵活性,是定制研究的理想选择。

植物基因分型
GeneSeek可为任何规模的定制项目提供基因分型服务:种子质量控制、转基因分析、全基因组扫描或标记辅助选择。

GeneSeek持续开发新方法和系统,用于从各类型植物中进行样本收集、储存、DNA提取和基因分型。从一个很小的叶片中,GeneSeek就能够使用专用的分子应用技术来分析感兴趣的目标。

定制基因分型解决方案:标记辅助选择(MAS)和管理(MAM)
GeneSeek 也提供强大而精确的质谱法用于SNP分型。GeneSeek 用灵活的可定制方案来提供常规基因分型服务(从 1 个到1,000 个SNP),帮助一些项目使用遗传信息来进行选择和繁育,这之中没有样本数目的限制。不管样本必须每天、每周还是每月进行基因分型,GeneSeek都可以提供灵活的周期和可用于任何应用的数据质量。
GeneSeek MAS项目的关键特性包括:
•  以质谱分析法为基础的检测系统可提供灵敏、准确且快速的分析。
•  便于使用的多重试验设计以及优化软件节省研究时间,并将效率最大化。


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