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在蛋白质组学所涉及的质谱技术中,常见的离子化方式有 MALDI 和 ESI 。目前,对这两种方法的原理和离子化的具体细节还没有一个公认的阐述。但经验表明, MALDI 所产生的离子化肽段只带一个电荷(正离子方式)。而 ESI 所产生的离子化肽段往往带有多个电荷。