在选择气相色谱仪进样方式时，应充分考虑分析准确性、实用性、经济性的原则，要选择有最高性价比的产品方式，如果被测组分的性质：如热不稳定、易分解、易催化反应的样品，要考虑时间、温度、压力等变化是否会引起被测样品组分的变化，可考虑冷柱上进样或手动进样，后者亦选择自动进样器方式，但是都要用针尖很细的进样器，色谱工程师认为，可从以下几个方面考虑。
一、色谱分析样品的性质
1.样品的组分和状态：可能为气态、液态、固态、或是混合态、要考虑是否能够直接用气相色谱仪分析。对于常规的气态、液态样品，能够直接进行分析的，可选用微量手动进样器、液体自动进样器或者阀进样器系统；如对分析结果要求高时的，气态样品可选择气体阀进样；如果对装备中的在线液体进样，可选择液体阀进样器；测定固态或者混合态样品中的挥发性组分，可根据实验室条件和实验目的，选择便携式气相色谱仪顶空进样器或者吹扫捕集进样系统。
2.被测组分的性质：如热不稳定、易分解、易催化反应的样品，要考虑时间、温度、压力等变化是否会引起被测样品组分的变化，可考虑冷柱上进样，可选择手动进样后者自动进样方式，但是都要用针尖很细的进样器。
3.样品中的杂质：是否有烟尘、悬浮物、高沸点组分或腐蚀性成分等，如有，要考虑样品的来源，并进行前处理，可选择能进行样品前处理的进样系统如固相微萃取进行系统、吹扫捕集进样系统，或者顶空进样系统等。
4.样品来源是否容易：如可消耗的样品组分多，将有利于选择进样方式。
二、色谱分析样品的目的
1.定性分析：要考虑被分析组分是否已知，有无标准样品，对进样系统要求高不高。
2.定量分析：在哪个定量范围，如常量、半微量、微量还是痕量或者超痕量。如是痕量或超痕量等对定量要求高的，则要选便携式气相色谱仪择进样准确且干扰因素少的进样方式。如气体进样可选择气体阀进样系统。
3.定量精密度和结果的准确度：若是定义要求就简单得多。
根据以上几点选择进样方式，就要求进样系统要准确和经济实用为主。
气相色谱仪工作原理：是利用试样中各组份在气相和固定液液相间的分配系数不同，当汽化后的试样被载气带入色谱柱中运行时，组份就在其中的两相间进行反复多次分配，由于固定相对各组份的吸附或溶解能力不同，因此各组份在色谱柱中的运行速度就不同，经过一定的柱长后，便彼此分离，按顺序离开色谱柱进入检测器，产生的离子流讯号经放大后，在记录器上描绘出各组份的色谱峰。
气相色谱（GC）是一种分离技术。实际工作中要分析的样品往往是复杂基体中的多组分混合物，对含有未知组分的样品，首先必须将其分离，然后才能对有关组分进行进一步的分析。混合物的分离是基于组便携式气相色谱仪分的物理化学性质的差异，GC主要是利用物质的沸点、极性及吸附性质的差异来实现混合物的分离。待分析样品在汽化室汽化后被惰性气体（即载气，一般是N2、He等）带入色谱柱，柱内含有液体或固体固定相，由于样品中各组分的沸点、极性或吸附性能不同，每种组分都倾向于在流动相和固定相之间形成分配或吸附平衡。
但由于载气是流动的，这种平衡实际上很难建立起来，也正是由于载气的流动，使样品组分在运动中进行反复多次的分配或吸附/解附，结果在载气中分配浓度大的组分先流出色谱柱，而在固定相中分配浓度大的组分后流出。当组分流出色谱柱后，立即进入检测器，检测器能够将样品组分的存在与否转变为电信号，而电信号的大小与被测组分的量或浓度成比例，当将这些信号放大并记录下来时，它包含了色谱的全部原始信息。便携式气相色谱仪在没有组分流出时，色谱图的记录是检测器的本底信号，即色谱图的基线。
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