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用Sep-Pak C18柱层析法纯化放射性标记的寡核苷酸实验

2020.8.10
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

试剂、试剂盒 乙腈碳酸氢铵TE 溶液放射性标记寡核苷酸

仪器、耗材 离心干燥机微量离心管放于管架或收集器Sep-Pak 经典层析柱注射器

实验步骤

材料


溶液和缓冲液

稀释贮存液至适当浓度。


乙腈(5%、30% 和 100%)

毎个 Sep-Pak C18 柱用 10 ml 髙效液相(HPLC) 级乙腈(100%), 使用前用水稀释乙腈。


碳酸氢铵(25 mmol/L,pH8.0)


含 5%(WV) 乙腈的碳酸氢铵(25 mmol/L,pH8.0)

将 5 ml 乙腈与 95 ml25 mmol/L 碳酸氢铵混合


TE 溶液(pH7.6)


核酸与寡核苷酸


放射性标记寡核苷酸


用于纯化的原料是方案 2(步骤 3 或步骤 5)的反应混含液,并已在 68°C 加热灭活噬菌体 T4 多核苷酸


专用设备


离心干燥机(Savant Speed Vac 或相应仪器)


微量离心管(1.5 ml) 放于管架或收集器

用于收集层析柱纯化的放射性标记寡核苷酸洗脱液


Sep-Pak 经典层析柱,短柱身

毎一 Sep-PBk 经典层析柱(可从 Millipore 公司的 Waters 部门购买)含有 360 mg 疏水反相层析树脂(C18)。纯化是利用寡核苷酸在溶剂(水溶液)极性较大时与树脂结合,而在熔剂(如甲醇与水混合液) 极性较小时脱落的原理。每一次磷酸化反应需要一个分离柱。


注射器(10 ml 聚丙烯注射器)


方法


1.Sep-Pak Cl8 反相层析柱准备如下:


a. 将装有 10 ml 乙腈的聚丙烯注射器连接于 Sep-PakC18 经典层析柱。


b. 用注射器缓慢冲洗层析柱。


c. 先将注射器与层析柱分离,再将注射器的柱芯抽出注射器针简,这样可以防止空气抽入层析柱内。将注射器针筒再连于层析柱上。


d. 用 10 ml 过滤无菌水洗去有机溶剂,共 2 次,每次冲洗后均重复步骤 c。


2. 用无菌水将放射性标记的寡核苷酸稀释至 1.5 ml, 并将全部样品用注射器推入层析柱。


3. 用下列四种溶液冲洗层析柱,每次冲洗后重复步骤 1c。


10 ml 25 mmol/L 碳酸氢铵(pH8.0)

10 ml 25 mmol/L 碳酸氧铵/5% 乙腈

10 ml 5% 乙腈

10 ml 5% 乙腈


4.3 份 lml30% 乙腈洗脱放射性标记的寡核苷酸,用 1.5 ml 微量离心管分别收集每个组分,每次洗脱后重复步骤 lc。

警惕:磷酸化反应常常使用大于 100uCi 的放射性标记 ATP, 因此这些层析组分的放射性剂量可能相当可观。应小心、谨慎处理未摻入的放射性物质、移液器吸头及微量离心管。


5. 用离心干燥机干燥含寡核苷酸的溶液(Savant SpeedVac 或相应仪器)。


6. 将放射性标记的寡核苷酸溶于小体积(10ul) 的 TE(pH7.6)。


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