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PCR 扩増实验

2020.8.11
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

试剂、试剂盒 dNTP混合物基因特异的正向引物基因特异的反向引物单链cDNATaqDNA聚合酶RT-PCR缓冲液

仪器、耗材 PCR仪PCR管

实验步骤

一、材料


1. 缓冲液、溶液和试剂


去除 RNA 酶的双蒸水


10XRT-PCR 缓冲液(100 mmol/LTris-HCl、pH8.3,500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)


2. 酶和酶缓冲液


TaqDNA 聚合酶(5U/ul)


3. 核酸和寡核苷酸


dNTP 混合物(10 mmol/L,包含所有四种 dNTP)


基因特异的正向引物(5umol/L)


基因特异的反向引物(5umol/L)


单链 cDNA(见第一部分)


4. 放射性复合物


[a-32P]dCTP(10uCi/ul)(lCi=37 GBq)


5. 实验器材


薄壁的 PCR 管


6. 专用仪器


可编程的 PCR 仪


二、方法


1. 准备 PCR 反应混合物。


由第一部分制得的 cDNA                      11ul


10XRT-PCR 缓冲液                              55ul


10 mmol/LdNTP 混合物                        44ul


5umol/L 基因特异的正向引物               22ul


5umol/L 基因特异的反向引物               22ul


5U/ulTaqDNA 聚合酶                            2.75ul


去除 RNA 酶的双蒸水                           387.75ul


[a-32P]dCTP(10uCi/ul)                         5.5ul


2. 平均 50ulPCR 反应混合物分别放入 10 个薄壁 PCR 管中。


3. 带有热盖的适当的 PCR 仪(如:GeneAmpPCRSystem9700,AppliedBioSystems)


上运行 PCR。PCR 扩增的循环参数如下。


94°C30s


退火温度 30s


72°C30s


35 个循环


4. 每次奇数脉冲循环后放在冰上取样,由第 15 个循环起始,到第 35 个循环终止。


5. 变性聚丙烯酰胺凝肢(6% 丙烯酰胺/8mol/L 尿素)上分析样品。每个样品上样


10ul。滤纸上干燥凝肢,用 Phosphorlmager 或 X 射线片和 densitometer 对产物定量,也可以将产物条带从凝胶上切下,通过闪烁记数仪定量。


6. 信号的对数(y 轴)对应循环数(x 轴)作图。选择处于线性范围中心的循环数在后


续实验中使用。


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